云南省中医医院男科始建于2001年，历经二十余年发展，科室已建成“‘十一五’”国家中医药管理局慢性前列腺炎补肾通利重点研究室、国家中医药管理局中医药重点学科中医男科学、国家中医药管理局优势学科继续教育基地中医男科学基地的挂靠单位和全国首家中医男科专业药物临床试验专业平台。同时系云南中医学院王琦专家工作站、中华中医药学会名医名家秦国政科普工作室、中华中医药学会男科分会名誉主任委员挂靠单位。 临床研究方面：牵头制定了不育症（精索静脉曲张）、血精（精囊炎）、子痈（急慢性睾丸附睾炎）、精癃（良性前列腺增生症）、石淋（尿石症）五个国家中医药管理局中医男科优势病种诊疗方案和临床路径。 科学研究方面：累计立项科研项目35项，其中国家自然基金项目6项、国家中医药管理局项目5项、省级项目9项、厅局级项目15项；发表学术论文207篇、出版著作 22 部。获批实用新型专利3项、软件著作权 4项。研发并获批院内制剂2项。 教育教学方面：在全国独家开办了中医学专业男科方向本科学历教育，连续开设全校性公共选修课《中医男科学》课程，组织编写出版了首部中医男科学课程教材《新世纪全国高等中医药院校创新教材<中医男科学>》、首部普通高等教育“十三五”规划教材 ·全国高等医药院校规划教材《中医男科学》，供全国高等中医药院校使用。   获奖：获云南省卫生科技成果奖一等奖1项、三等奖5项、云南中医药大学高等教育教学成果一等奖1项、二等奖3项以及各类奖项共计22项。